Вторым боссом в Sonic the Hedgehog 2 выступает Water Eggman — Доктор Эггман сидит в своём эггмобиле, к которому прикреплена система труб, питающая большой резервуар с кислотой, из которой Эггман будет стрелять в Соника. При этом устойчивой частью поля боя является только середина арены, которую и будет обстреливать Эггман. Если игрок будет перемещаться по качающимся платформам, босс просто будет двигаться взад-вперёд.
Босса следует бить по возможности аккуратно, поскольку в случае получения урона игрок может легко отлететь в сторону и упасть в кислоту, если пол перевернётся.