Sonic 3 & Knuckles is het spel dat verkregen wordt door Sonic 3 aan te sluiten op Sonic & Knuckles, met behulp van de revolutionaire Lock-on Technology. Dit spel is Sonic 3 zoals het bedoeld was door Sega. Door tijdsgebrek moest Sonic 3 zoals het toen was gesplitst worden in Sonic 3 en Sonic & Knuckles. Dit spel maakt de splitsing eigenlijk ongedaan.
Sonic 3 & Knuckles staat de speler toe om alle veertien Zones achter elkaar te spelen. Bovendien staat het de speler toe om te spelen als Knuckles in Sonic 3 levels, waar Knuckles een hoop extra routes kan vinden. Tails wordt zo ook speelbaar in Sonic & Knuckles.