Si elegiste a Knuckles, te encontraras con él en el Hotel Restaurant de Station Square donde tendras que enfrentarte con él. Sonic,Tails y Knuckles lo encuentran más tarde en una piscina en Mystic Ruins antes de que se transforme a Chaos 4.
Al transformarse en Chaos 2, Chaos desarrolla un incremento en su altura y musculatura, además, le crecen huesos en el brazo izquierdo el los cuales estaban ausentes en Chaos 1 (solo tiene huesos en el brazo derecho), se puede ver las 2 Chaos Emeralds incrustadas en dichas extremidades. Su cerebro es facilmente visible y este presenta una especie de cuernos a sus lados, lo cual le dan una apariencia a un martillo. Además aprende nuevos poderes como un escudo azul y el transformarse en una gran bola de agua que rebota.
Aparece en el episodio "Pure Chaos". Después de la aparicion de Dr. Eggman, él le lanza la Chaos Emerald de Cream, haciendo que Chaos 0 se transforme a Chaos 1. En el mismo momento, le lanza otra Chaos Emerald para que se transforme a Chaos 2. En eso, Sonic y Knuckles intervienen en la escena para luchar contra Chaos 2, luego de una dura lucha es derrotado. El episodio finaliza al llevar a Chaos 2 con Dr. Eggman huyendo del lugar.
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