El Catcher Eggman es similar al Eggmobile estilizado, con una gran cantidad de luces y otros coloridos detalles. Tiene forma como el de un OVNI. Tiene unas pinzas amarillas por debajo, posee múltiples colores como rojo, azul, amarillo y gris en la parte de arriba y en el torso. En ambos juegos, el jugador debe enfrentarlo en una larga arena de pinball con varios elementos de un pinball.
Al final del Acto 2 de Casino Night Zone, la batalla contra el jefe empieza en un área cerrada con dos flippers de pinball y un triángulo individual en el medio. El jugador puede moverse normalmente usando las rampas para moverse arriba de las secciones del pinball usando el Spin Attack o el Spin Dash para mayor velocidad. Todo el sitio posee varios bumpers, los cuales el jugador puede usarlos para balancearse y atacar al Eggmobile. Cuando el jugador entra a la arena, la ruta por donde entras se cerrará para la batalla contra el jefe.
El jefe en sí es el Dr. Robotnik en su Eggmobile, quien se mantiene flotando de un lado a otro sobre la arena. La parte de abajo del vehículo deja caer bolas rojas con picos que sueltan bolas moradas con el impacto. Además de las bolas rojas que suelta, la parte inferior es protegida por un campo de electricidad. Para derrotarlo, uno debe usar los flippers para enviar a Sonic en el aire y que caiga sobre el Eggmobile o usando el Spin Dash para subir una de las paredes y luego saltar hacia el Eggmobile.
Como los otros jefes de este juego, requiere de ocho golpes para destruirlo. Una vez esto, Robotnik se irá volando de ahí en el Eggmobile destruido y así el jugador podrá abrir la cápsula y pasar el nivel.
En este juego el Catcher Eggman vuelve a aparecer como el segundo jefe del juego en el nivel de Casino Street Zone en el Acto del Jefe. Al igual que Sonic 2, la batalla se desarrolla en una larga arenade pinball, solo que esta vez solo hay dos flippers. El modo de ataque en este juego del Catcher Eggman es diferente al original, ya que esta vez Eggman es capaz de agarrar a Sonic con las pinzas de abajo del Eggmobile para luego soltarlo sobre tres sets de picos, los cuales están ocultos en el centro de la arena.
Después de darle cuatro golpes, Eggman se prepara para realizar su nuevo ataque, el cual consiste en que Eggman se coloca un escudo por encima de él y de su vehículo y luego empieza a dar vueltas por toda la pantalla. El peligro aquí es que si el jugador toca el Eggmobile mientras hace esto, se dañará y perderá sus rings debido al campo eléctrico de las pinzas. El jugador puede golpearlo después de haber dado las vueltas. Después de darle otros cuatro golpes, el Catcher Eggman se destruirá y Eggman se irá volando de ahí, luego de eso el jugador ya puede abrir la cápsula y pasar al siguiente nivel.
Más tarde en este mismo juego el Catcher Eggman vuelve aparecer en el nivel de E.G.G. Station Zone, el cual es el sub-jefe del nivel antes que el jefe final. El escenario donde se desarrolla esta pelea es parecido al anterior y la forma de batalla es la misma.
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